商学院2005年开设电商专科，2017年升格本科，2026年正式转型为跨境电商专业。目前共有专任教师8人，其中，教授1人，副教授5人，讲师2人，硕士研究生导师5人，电商高管2人，具有博士学位5人。
近三年，专业通过组建科研团队，整合科研力量，凝练科研方向，科研成果显著，目前主讲教师承担国家社科基金项目1项，海南省哲学社会科学基金项目3项，三亚市社科基金项目3项，荣获三亚市哲学社会科学优秀成果奖3项，会议论文获奖1项，发表学术论文10余篇。
跨境电商专业面向全球化与区域经济发展需求，紧密结合海南自贸港建设战略，依托自贸港政策与区位优势，坚持复合型应用人才培养定位，构建融合管理学、经济学、国际贸易、计算机、外语及法律等多学科交叉的知识体系。。课程设置突出实践导向，涵盖跨境电商平台运营、国际物流、数据分析、法律合规及创新创业实践等核心环节，并强化实验、实训、实习与毕业论文等实践教学，同时注重跨文化沟通能力与职业素养的培育，旨在培养能够适应跨境电商运营、国际营销、数据分析与决策等岗位，服务海南自贸港建设与发展的高素质复合型人才。
专业加强实践教学，已与海南德航、深圳伍壹叁跨境、杭州赢动教育、白沙电商中心等9家企业单位建立了校外实习实训基地，累计接纳学生见习、实习数500余人。专业引入真实GMV运营项目，学生全程参与选品、上架、投流、履约等环节，积累实战经验，无缝衔接的校企合作机制，为学生提供真实的实习机会与优质的就业通道。
专业鼓励学生积极参加学科各类竞赛活动，激发学生学习内在动力，连续三年承办全国大学生电子商务“创新、创业及创意”挑战赛海南热带海洋学院校级赛。学生在全国大学生电子商务“创新、创业及创意”挑战赛、泛珠三角大学生计算机作品大赛、“挑战杯”全国大学生创业计划大赛、全国跨境电子商务竞赛、移动商务技能竞赛、市场营销大赛等竞赛中均取得优异成绩，共计获得国家级比赛奖项22人次，省市级比赛奖项35人次。
学生参加第三届奥派杯全国移动商务技能竞赛全国总决赛
学生参加全国大学生电子商务“创新、创业及创意”挑战赛省级赛
学生参加泛珠三角大学生计算机作品赛海南省赛
聘任阿里巴巴三亚负责人等为创业导师
承办全国大学生电子商务“创新、创意及创业”挑战赛校级赛
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